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確かに遅くなる場合があると思います。
クイック全置換は一行ずつではなくて、全体を１つの対象としていて、検索文字列に
改行と解釈可能なものが含まれて、長さが変わるようなケースではとても長い一行と
同じになってしまうため、そうなってしまうと思われます。
そういう可能性もあるということをヘルプに書いておこうと思います。
クイック全置換ではない通常の置換の場合は、全体ではなくて検索文字列に含まれる
\nの数とか、(?#maxlines:数値)によって行数が制限されるので、結果的に遅くなる
のが回避されています。
（詳細はヘルプの「目次− 検索系コマンド− 正規表現− \nを使った複数行検索の
際の制限について」）
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